Computational Modeling in Glycoscience

13 July 2021
La puissance des systèmes de calcul haute performance ont permis aux méthodes de simulation moléculaire de jouer un rôle de plus en plus important dans l’interprétation des données expérimentales, voire de les transcender dans la conception de nouvelles expériences et de mener, de manière autonome, à de nouvelles découvertes scientifiques. Cette revue présente les fondements des méthodes de simulation moléculaire multi-échelles, de l'atomistique au gros grain, utilisées dans la recherche sur les glucides complexes. Les applications aux glycanes et glycoconjugués, aux polysaccharides, aux interactions protéines-glycanes,... illustrent la pertinence de l'utilisation des simulations informatiques dans tous ces domaines des glycosciences. Cliquez sur le titre pour plus d'informations.

Résumé:

« The ubiquitous occurrences of glycans (from oligo to polysaccharides) as cell components to significant constituents of the terrestrial biomass provide the glycans with a panel of biological functions and physicochemical properties. The progress made in algorithms and computational power allows for the simulation of glycans in their natural environment, and new dimensions, both spatial and temporal, can be assessed. The review will illustrate advancements in high-performance computing have allowed molecular simulation methods not only to play a more substantial role in supporting experiments but to transcend such mandate to guide experimental design and to lead autonomously scientific discovery. »

Le chapitre est disponible ici.